スウェーデン南部の農村で育ったいたずら好きの少年・ニルスは、部屋で捕まえた妖精の怒りを買ってしまい、ハムスターのキャロットと共に魔法で小さくされてしまう。小さくなったニルスは動物の言葉が分かるようになるが、日頃いじめていた家畜たちに仕返しをされ逃げ回る。そんな中、ガンの群れにからかわれ、空に飛び立とうとしていたガチョウのモルテンに飛びつき―。
キャロット、モルテンと共にガンの群れの移動に巻き込まれてしまったニルスは、群れが一夏を過ごす土地・ラップランドを目指すことに。さまざまな出会いを通じて、少年が人間的に成長していく姿を描いた作品。
ぴえろ制作の記念すべきTVアニメーション第１作。総監督を設立者の１人である演出家・鳥海永行が務めている。