旧世紀末期、国家間の争いはかつてないほどの被害を生み、その副産物として「国家」という枠組みが力を失う中、新たな拠り所を求めた人々は「都市」と「企業」に帰属意識を見出していた。
超能力者保護を謳う企業「アシュラム」、その能力者部隊に所属する戒=玖堂は、放棄された巨大都市ガルドでのゲリラ掃討戦に参加する。だがそこで負傷し、帰還できなくなった自分を助けてくれたガルドで暮らす勇基、明日香たちとの出会いによってアシュラムの実態を知る。自分たち「能力者」が普通の人々から恐怖と嫌悪の対象として蔑まれ、憎まれているということも……。
そんな戒の葛藤とは無関係に、アシュラムはある野望と結託し暴走を開始する。否応無く戒を争いに巻き込みながら―E’S（エス）と呼ばれる超能力を持つ戒の戦いと苦悩を描くSFアクション。