止められなかったうちはサスケとの別れから数年、様々な思いを胸に忍として成長を遂げたうずまきナルトは、修業を終え木ノ葉隠れの里に帰ってきた。尾獣の力を狙い世界を暗躍する「暁」との激闘を繰り広げながら、その首領ペイン自らが九尾奪取を目的として仕掛けてきた侵略から木ノ葉隠れの里を守るために戦うナルト。一方、兄の死の真相を知り木ノ葉隠れの里への復讐を心に決めたサスケは、ナルトと再び相まみえる。
２人の決着は見えぬまま、忍界すべてを巻き込んだ第四次忍界大戦が勃発。運命に導かれ、彼らは忍の祖と対峙することとなり―ナルトとサスケの波乱に満ちた「絆」の物語、ここに完結！
原作コミック『NARUTO-ナルト-』の第２部を描くTVシリーズで、放送期間10年・全500話は、どちらもぴえろの単一タイトル作品としては最長となる。