2047年、地下50,000mの神話層から金属鉱「ガイメタル」が発見された。高純度のエネルギー金属であるガイメタルは新エネルギー資源として期待され、世界中で採掘が行われるようになる。しかし2055年、全身をガイメタルで覆われている金属生命体「ガイスト」が出現し、人々を襲い始めた。そんなガイストの脅威に対抗するために、人類は世界の科学力を集結させた超国家ガイスト対策組織「ガイストクラッシャーギャリソン」（通称「GCG」）を設置する。
主人公の白銀レッカは正義感に強く一本気な少年。レッカはガイストであるテッコウ・リュウジンに襲われた事件をきっかけに、「ガイストクラッシャー」としての道を歩き出す―。
カプコンから発売された同名のニンテンドー3DS用ゲームソフトを原作とするTVアニメ化作品。